33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1772 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1704  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.220513  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1772  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00902613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1725  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  46.63 
 
 
341 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  44.21 
 
 
348 aa  255  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13088  hypothetical protein  44.03 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.193981  normal  0.734737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  42.77 
 
 
357 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  34.52 
 
 
114 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  33.7 
 
 
417 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  37.65 
 
 
125 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  37.65 
 
 
125 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  32.38 
 
 
115 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  31.46 
 
 
114 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  34.44 
 
 
123 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  31.46 
 
 
112 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  32.14 
 
 
114 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  39.34 
 
 
112 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  30.93 
 
 
116 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  32.58 
 
 
119 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.84 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  30.69 
 
 
131 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  30.11 
 
 
115 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  31.11 
 
 
112 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  27.37 
 
 
112 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  34.02 
 
 
128 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  36 
 
 
113 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  22.11 
 
 
113 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  28.57 
 
 
115 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  30.49 
 
 
116 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  30.95 
 
 
119 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  30.95 
 
 
119 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>