45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13088 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13088  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  756    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.193981  normal  0.734737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  52.89 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  51.84 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  47.62 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1704  hypothetical protein  44.03 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.220513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1772  hypothetical protein  44.03 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00902613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1725  hypothetical protein  44.03 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  35.23 
 
 		 114 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  32.65 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  34.12 
 
 		 125 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  32.1 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  33.67 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  34.12 
 
 		 125 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  32 
 
 		 110 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  31 
 
 		 112 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  27.27 
 
 		 112 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  32.26 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  34.41 
 
 		 114 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  31.13 
 
 		 115 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  30.53 
 
 		 436 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  31.3 
 
 		 131 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  30.69 
 
 		 123 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  28.85 
 
 		 112 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  30.23 
 
 		 108 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.11 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  27.38 
 
 		 102 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  30.19 
 
 		 119 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  29.55 
 
 		 110 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  29.47 
 
 		 126 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  31.58 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  33.66 
 
 		 115 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  30.09 
 
 		 114 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  29.29 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  28.89 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  30.21 
 
 		 114 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  28.89 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  25.3 
 
 		 113 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  31.91 
 
 		 116 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  24.77 
 
 		 128 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>