99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1697 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  803    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  78.5 
 
 
414 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  34.14 
 
 
409 aa  183  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
427 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
428 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.55 
 
 
426 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  32.48 
 
 
436 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.81 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  29.43 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  28.4 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.04 
 
 
417 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  42.57 
 
 
113 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  43.43 
 
 
115 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  41.35 
 
 
112 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  43.62 
 
 
126 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  42.72 
 
 
125 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  42.72 
 
 
125 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.71 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  42.27 
 
 
110 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  40.78 
 
 
114 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  39.18 
 
 
110 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  41.24 
 
 
119 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  34.31 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  37.11 
 
 
112 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  38.68 
 
 
131 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  41.24 
 
 
114 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  40.2 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  32.43 
 
 
130 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  35 
 
 
114 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  38.61 
 
 
109 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  37.25 
 
 
115 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  39.25 
 
 
114 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  32.99 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  35.35 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  34.04 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  37.36 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  36.17 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  36.17 
 
 
115 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  36.46 
 
 
116 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  32.65 
 
 
101 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  29.9 
 
 
108 aa  67  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  30.93 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  38.82 
 
 
113 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  38.95 
 
 
119 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  34.65 
 
 
114 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  38.95 
 
 
119 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  37.63 
 
 
107 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  31 
 
 
102 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  33.66 
 
 
123 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  30.93 
 
 
107 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  31 
 
 
102 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  34.07 
 
 
105 aa  63.2  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  31.63 
 
 
114 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  32.65 
 
 
108 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  32.38 
 
 
112 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  32.97 
 
 
111 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  35.11 
 
 
108 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  29 
 
 
111 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  36.08 
 
 
116 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  34.69 
 
 
109 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  33.67 
 
 
109 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  30.34 
 
 
112 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  31.91 
 
 
113 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  27.72 
 
 
114 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  39.29 
 
 
103 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  29.29 
 
 
110 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  32.69 
 
 
341 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  26.55 
 
 
114 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  26.72 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  25.77 
 
 
101 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  30.21 
 
 
111 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  30.59 
 
 
118 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  30.21 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  32.86 
 
 
103 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0469  CBS domain containing protein  30.3 
 
 
138 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 
688 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
105 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
689 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13088  hypothetical protein  29.29 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.193981  normal  0.734737 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  29.82 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 
225 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1037  hypothetical protein  32.93 
 
 
104 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  37.7 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  21.09 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 
171 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  27.15 
 
 
141 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
224 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
209 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  23.59 
 
 
380 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2600  protein of unknown function DUF190  38.75 
 
 
99 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 
232 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>