64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4483 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4483  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  57.58 
 
 
101 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34.41 
 
 
270 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  34.12 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  30.11 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  29.89 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  27.96 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  27.96 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  26.88 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  27.96 
 
 
102 aa  52  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  26.37 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  27.96 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  27.37 
 
 
110 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  30 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  28.87 
 
 
115 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  27.66 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  30.59 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  31.46 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  27.96 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  24.73 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  25 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  26.32 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  22.99 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  26.32 
 
 
433 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  27.96 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  26.32 
 
 
436 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  34.09 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  27.47 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  23.66 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  32.58 
 
 
105 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  26.32 
 
 
111 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  27.85 
 
 
125 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  27.85 
 
 
125 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  30.77 
 
 
108 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  23.66 
 
 
114 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  28.09 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  26.44 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  35.8 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  28.09 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  26.09 
 
 
112 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  29.41 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
428 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  23.96 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.37 
 
 
426 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  22.92 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  30.86 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  26.09 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  22.83 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  29.03 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  31.91 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  29.79 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  23.66 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  24.24 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  32.14 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  30.85 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  22.58 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  25 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  22.11 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  27.55 
 
 
414 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  26.09 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  25.93 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>