18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0511 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0511  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  223  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  32.56 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  32.56 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  32.56 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  31.4 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  31.4 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  31.4 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  31.4 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  27.27 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  24.44 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  31.4 
 
 
273 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  26.67 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  26.61 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>