39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0518 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  38.96 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  43.06 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  43.06 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  37.84 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  38.03 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  36.71 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  38.57 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  35.21 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  36.62 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  36.49 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  34.67 
 
 		 426 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  36.49 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  40.54 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  39.71 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  40.54 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  42.25 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  35.21 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  34.67 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  30.99 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  31.08 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  41.56 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  35 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  40.79 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  38.24 
 
 		 417 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  35 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  29.58 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  31.08 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  29.73 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  35.21 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  35.21 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  30 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  38.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  36.51 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  27.03 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  29.27 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>