More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2299 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  100 
 
 
611 aa  1238    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.02 
 
 
671 aa  704    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  44.82 
 
 
623 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  40.42 
 
 
628 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  40.38 
 
 
593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  37.87 
 
 
648 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
594 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
642 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.58 
 
 
634 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  38.24 
 
 
648 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  38.21 
 
 
635 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  36.05 
 
 
641 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.07 
 
 
622 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  39.47 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  37.4 
 
 
642 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
632 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  36.56 
 
 
638 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  37.15 
 
 
632 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  37 
 
 
658 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  36.83 
 
 
622 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
624 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  36.67 
 
 
658 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.89 
 
 
627 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
640 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
628 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  35.58 
 
 
636 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  33.39 
 
 
654 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.11 
 
 
626 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.98 
 
 
614 aa  388  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  35.06 
 
 
637 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  39.65 
 
 
593 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.57 
 
 
613 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  35.73 
 
 
635 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  34.79 
 
 
626 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  37.4 
 
 
607 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  34.73 
 
 
627 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  34.73 
 
 
627 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  35.09 
 
 
687 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.21 
 
 
617 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  38.02 
 
 
589 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  36.95 
 
 
626 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  34.21 
 
 
637 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  34.82 
 
 
639 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  34.27 
 
 
638 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  34.06 
 
 
622 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  33.23 
 
 
624 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.83 
 
 
627 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
640 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.26 
 
 
597 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  36.17 
 
 
627 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.26 
 
 
597 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  37.29 
 
 
578 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  37.29 
 
 
578 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  34.62 
 
 
631 aa  361  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.37 
 
 
598 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  33.84 
 
 
659 aa  361  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.46 
 
 
598 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 
571 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  35.31 
 
 
638 aa  359  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.69 
 
 
586 aa  359  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.52 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.52 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.43 
 
 
631 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.34 
 
 
586 aa  357  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.34 
 
 
586 aa  357  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.69 
 
 
586 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.34 
 
 
586 aa  357  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.34 
 
 
586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.72 
 
 
586 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.34 
 
 
586 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  34.28 
 
 
663 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.92 
 
 
578 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.67 
 
 
556 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.74 
 
 
602 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  33.9 
 
 
620 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  35.23 
 
 
582 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  33.45 
 
 
648 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.05 
 
 
584 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
575 aa  350  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.78 
 
 
614 aa  350  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  38.32 
 
 
597 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.2 
 
 
601 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.91 
 
 
579 aa  349  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.95 
 
 
600 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.2 
 
 
585 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.96 
 
 
600 aa  347  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.71 
 
 
587 aa  347  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  34.75 
 
 
597 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.11 
 
 
631 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.39 
 
 
581 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
577 aa  343  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 
598 aa  342  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
598 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
620 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.26 
 
 
572 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
618 aa  339  7e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 
605 aa  340  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.7 
 
 
607 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>