More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1959 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 472 aa  933    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  41.52 
 
 		 461 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  43.18 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 455 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  34.9 
 
 		 455 aa  256  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  36.1 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.86 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.05 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  31.74 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  31.19 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  30.57 
 
 		 496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 456 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 451 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  31.32 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 466 aa  180  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.16 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.05 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.57 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 448 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.57 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.79 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.57 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  27.07 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.08 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.18 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  25.96 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  26 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.56 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.24 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  24.94 
 
 		 448 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.84 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.62 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 456 aa  143  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.43 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  23.71 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 442 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26.24 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.29 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  24.72 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  23.84 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.3 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  24.95 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.26 
 
 		 446 aa  123  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>