More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1110 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 400 aa  805    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  38.77 
 
 		 416 aa  309  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  40.49 
 
 		 464 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  39.66 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  37.99 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  37.5 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  41.39 
 
 		 414 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  39.32 
 
 		 414 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  37.92 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  36.93 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02866  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11840)  25.79 
 
 		 559 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.94 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.94 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  25.07 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  24.61 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.93 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.21 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  25.53 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  32.64 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.97 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.83 
 
 		 350 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.8 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  28.71 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.54 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  34 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.77 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  22.44 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.77 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  36.24 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.91 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.63 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  33.91 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.33 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.11 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  25.33 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  29.44 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  30.43 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.79 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  32.21 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>