More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1775 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 525 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  34.35 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  34.29 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  36.08 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  33.59 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  54.55 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  34.51 
 
 		 316 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  29.32 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.78 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  30.97 
 
 		 329 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  30.97 
 
 		 329 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2824  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 378 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00113458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  30.18 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  43.24 
 
 		 351 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  31.3 
 
 		 120 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  29.6 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  55.88 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.14 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  32.73 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  39.06 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  37.88 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 282 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  31.3 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  44.07 
 
 		 306 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  40.98 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  35.65 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  28.8 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  36.14 
 
 		 465 aa  47.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  46.55 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  44.07 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>