More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1355 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 455 aa  932    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  37.35 
 
 		 479 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  36.66 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  36.43 
 
 		 479 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  36.66 
 
 		 479 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  31.97 
 
 		 925 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  33.7 
 
 		 778 aa  220  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  34.69 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  33.63 
 
 		 998 aa  219  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  35.02 
 
 		 463 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  34.69 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  34.31 
 
 		 795 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  32.3 
 
 		 796 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 813 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 813 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  30.07 
 
 		 796 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  34.35 
 
 		 971 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  30.47 
 
 		 809 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  30.47 
 
 		 809 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  32.19 
 
 		 815 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  30.94 
 
 		 799 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  31.45 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  33.57 
 
 		 788 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  34.9 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  34.63 
 
 		 786 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  31.62 
 
 		 785 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  33.75 
 
 		 794 aa  179  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  30.6 
 
 		 768 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  29.77 
 
 		 920 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  30.89 
 
 		 652 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  28.53 
 
 		 630 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  29.75 
 
 		 647 aa  123  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 654 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.85 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  29.79 
 
 		 650 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  28.4 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.37 
 
 		 551 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  28.84 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 666 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.36 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.3 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.09 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  28.36 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  25.13 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  25.65 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  26.81 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.74 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.44 
 
 		 649 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  30.22 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.46 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.24 
 
 		 773 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  26.07 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  26.19 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.12 
 
 		 488 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  25.42 
 
 		 509 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.62 
 
 		 531 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  25.89 
 
 		 509 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.7 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  25.93 
 
 		 953 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  25.93 
 
 		 953 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.07 
 
 		 657 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  26.01 
 
 		 531 aa  87  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 946 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  32.75 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  27.87 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  27.09 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.71 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  28.05 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  23.86 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  30.96 
 
 		 658 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.11 
 
 		 974 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  24.59 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  26.84 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 1149 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  25.41 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  27.67 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.24 
 
 		 993 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  27.14 
 
 		 1028 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  24.04 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  24.61 
 
 		 952 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.11 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  25.41 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  25.41 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  25.41 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  24.55 
 
 		 1053 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  27.08 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.25 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  25.41 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  23.58 
 
 		 583 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  26 
 
 		 551 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  25.9 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  25.9 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>