140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0794 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0794  nuclease  100 
 
 		 327 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  47.2 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  55.56 
 
 		 218 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  52.22 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  52.35 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  50 
 
 		 276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  36.76 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  39.29 
 
 		 214 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  38.41 
 
 		 190 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  38.41 
 
 		 190 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.27 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  40.99 
 
 		 180 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  42.65 
 
 		 178 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  43.26 
 
 		 175 aa  95.9  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  43.07 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  42.18 
 
 		 191 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  32.75 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  39.72 
 
 		 190 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  42.18 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  35.87 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  36.36 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  35.33 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.03 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  33.33 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  59.62 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  32.08 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  38.71 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  32.08 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  26.79 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  35.46 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.12 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.13 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.44 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  27.98 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  27.98 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.71 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.99 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  38.1 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.15 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  32.41 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  36.11 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  27.55 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  32.24 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  40.18 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  28.14 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  32.93 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  26.7 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  37.32 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  35.21 
 
 		 228 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  35.21 
 
 		 228 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  35.81 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1455  hypothetical protein  53.57 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.463604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  25.76 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  31.25 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  29.22 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.84 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  30.19 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  31.41 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  24.77 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  31.41 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  36.07 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.75 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.14 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.01 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.45 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.45 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  29.25 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  29.68 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  32.38 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  29.63 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.56 
 
 		 175 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  32.34 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.58 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.25 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.77 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 153 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  28.77 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  33.56 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.64 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.56 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  27.85 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  34.25 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  36.3 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  26.8 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  34.88 
 
 		 115 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  27.89 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  34.23 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  27.33 
 
 		 179 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.95 
 
 		 180 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.75 
 
 		 206 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  26.71 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 171 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  32.88 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.18 
 
 		 192 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  31.11 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  28.03 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  29.5 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  27.8 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>