More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0525 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.03 
 
 
209 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  40.87 
 
 
217 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  40.19 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  38.76 
 
 
215 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.81 
 
 
219 aa  147  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  40.89 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  35.75 
 
 
215 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  35.27 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  34.78 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  34.78 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  34.78 
 
 
216 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  34.78 
 
 
216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  35.27 
 
 
216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  35.1 
 
 
216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  34.78 
 
 
216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  34.3 
 
 
216 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  35.55 
 
 
212 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  38.05 
 
 
214 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  38.89 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  37.56 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.37 
 
 
225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.37 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.8 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  38.76 
 
 
221 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.17 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.47 
 
 
217 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  31.1 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.34 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
206 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
216 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
223 aa  104  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.82 
 
 
213 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.82 
 
 
213 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.31 
 
 
213 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
225 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 
225 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
214 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.34 
 
 
218 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 
225 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.55 
 
 
227 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
228 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 
238 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
227 aa  98.2  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
235 aa  97.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  30 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  35.55 
 
 
239 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  34.01 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  31.63 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 
257 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  29.11 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.33 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  35.52 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.56 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
272 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 
272 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.91 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
272 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 
227 aa  92  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 
217 aa  92  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 
226 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  31.25 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.51 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 
218 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.06 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.44 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  34.52 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  32.41 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
272 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
223 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 
241 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>