More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3043 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
376 aa  775  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  34.29 
 
 
384 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  32.82 
 
 
415 aa  180  3e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 
398 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
430 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 
418 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 
424 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 
434 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 
434 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  31.65 
 
 
398 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 
430 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 
425 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 
431 aa  137  3e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 
426 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 
431 aa  134  2e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 
413 aa  134  4e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.68 
 
 
420 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
445 aa  132  8e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 
440 aa  130  4e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 
423 aa  129  1e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.68 
 
 
457 aa  128  2e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  31.08 
 
 
435 aa  127  4e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  30.39 
 
 
424 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 
423 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 
423 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 
443 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 
444 aa  121  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29.38 
 
 
431 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 
395 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 
390 aa  118  2e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
443 aa  117  2e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
455 aa  114  2e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 
409 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.93 
 
 
396 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.98 
 
 
408 aa  112  8e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 
391 aa  111  2e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 
419 aa  111  2e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
402 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.99 
 
 
444 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  31.23 
 
 
466 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.59 
 
 
455 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 
390 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28.9 
 
 
414 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
406 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 
403 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 
390 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 
375 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.19 
 
 
409 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 
393 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 
390 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 
435 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 
362 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.93 
 
 
439 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.93 
 
 
439 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
393 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
415 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 
362 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.45 
 
 
406 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 
378 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  25.63 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 
436 aa  96.7  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
396 aa  96.3  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 
458 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.63 
 
 
445 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.52 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 
453 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
423 aa  93.6  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 
380 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  26.51 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
400 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
406 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25.3 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  26.86 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.98 
 
 
461 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  26.3 
 
 
429 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 
406 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  25.06 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
429 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 
379 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 
391 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.99 
 
 
365 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 
453 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 
452 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
374 aa  86.3  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>