216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2246 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 		 209 aa  299  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  67.8 
 
 		 209 aa  290  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 210 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  64.56 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 209 aa  280  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  63.16 
 
 		 211 aa  278  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  56.81 
 
 		 214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  56.68 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  53.33 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  55.88 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  55.39 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  55.05 
 
 		 211 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  53.03 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  53.03 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  48.02 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  55.5 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  57.14 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  54 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  53.43 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  55.08 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  52 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  52.97 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  53.48 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  50 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  51.47 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  55.68 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  52 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  50.77 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  50.98 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  53.68 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  49.51 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  48.04 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  49.27 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  49.23 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  47.37 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  51.89 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 207 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  48.5 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  51.89 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  46.67 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  47.09 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  48.78 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  48.5 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  50.81 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  48.06 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  46.19 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  51.81 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  52.97 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  50.8 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  47.5 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  48.66 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  48.13 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  48.92 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  48.92 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  47.59 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  48.39 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  49.73 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  46.38 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  45.95 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  32.99 
 
 		 550 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.76 
 
 		 389 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  34.84 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  34.67 
 
 		 583 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.73 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 582 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  30.23 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  33.55 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  34.34 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  31.9 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  31.47 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  30.72 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.73 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  28.11 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.38 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.31 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  29.57 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.51 
 
 		 385 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  30.54 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  34.27 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  31.17 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.03 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  33.94 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.25 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  31.58 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  33.33 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  31.71 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  29.31 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  32.26 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  27.75 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  29.94 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  29.89 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00420  ribonuclease D  33.72 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  31.93 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  32.26 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>