More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0520 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 286 aa  560  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  52.69 
 
 		 278 aa  279  5e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  50.18 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  49.46 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0590  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  47.86 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.35 
 
 		 316 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  40.87 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  40.09 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 		 317 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  35.27 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  38.86 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  35.57 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  42.44 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  39.23 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  39.23 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  42.16 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  39.61 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  39.61 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  30.66 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1588  protoheme IX farnesyltransferase  30.95 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  41.18 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 622 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  34.65 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  37.69 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  40.31 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  41.12 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  32.44 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.9 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  39.91 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  40.38 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  42.42 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  42.42 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  39.59 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.77 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  35.53 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  37.26 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  35.61 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  38.05 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 534 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  37.44 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  34.53 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  35.27 
 
 		 483 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  37.39 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  38.12 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  34.45 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  34.91 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  32.38 
 
 		 624 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  36.28 
 
 		 535 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  40.38 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  34.93 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  38.4 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  33.64 
 
 		 317 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  38.24 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  33.64 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  37.82 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  35.11 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  37.82 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  32.4 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  36.6 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  36.19 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  36.02 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>