More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1560 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1392  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.87 
 
 
1049 aa  868  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.59 
 
 
1040 aa  862  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0132  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.32 
 
 
1045 aa  798  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.58 
 
 
1062 aa  762  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.04 
 
 
1059 aa  778  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.94 
 
 
1050 aa  790  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3817  multidrug resistance protein MdtF  41.6 
 
 
1037 aa  778  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0885908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.51 
 
 
1037 aa  846  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  41.74 
 
 
1049 aa  788  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.74 
 
 
1049 aa  788  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.61 
 
 
1037 aa  847  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.91 
 
 
1034 aa  779  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.5 
 
 
1037 aa  774  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.115131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.87 
 
 
1050 aa  801  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.35 
 
 
1043 aa  795  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.02 
 
 
1047 aa  763  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.87 
 
 
1050 aa  782  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.82 
 
 
1066 aa  782  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0931  multidrug-efflux transporter  40.5 
 
 
1055 aa  788  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.56 
 
 
1061 aa  768  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5127  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.79 
 
 
1043 aa  794  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5023  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.73 
 
 
1074 aa  763  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00482  AcrB protein  41.5 
 
 
1056 aa  785  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.64 
 
 
1050 aa  771  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3257  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.24 
 
 
1073 aa  794  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662335  normal  0.89676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.48 
 
 
1055 aa  926  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3912  multidrug resistance protein MdtF  41.6 
 
 
1037 aa  775  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  41.74 
 
 
1049 aa  787  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.73 
 
 
1089 aa  868  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.73 
 
 
1089 aa  868  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.1 
 
 
1064 aa  803  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.13 
 
 
1062 aa  766  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.5 
 
 
1055 aa  786  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.32 
 
 
1066 aa  773  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.63 
 
 
1066 aa  776  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.25 
 
 
1057 aa  773  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.13 
 
 
1059 aa  781  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.34 
 
 
1063 aa  772  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  42.87 
 
 
1050 aa  801  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.51 
 
 
1037 aa  846  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  41.74 
 
 
1049 aa  788  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.12 
 
 
1069 aa  785  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0531  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.64 
 
 
1044 aa  763  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606405 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1775  acriflavine resistance protein B  59.81 
 
 
1051 aa  1264  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00032562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0564  AcrB protein  57.7 
 
 
1054 aa  1221  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3068  acriflavine resistance protein B  42.87 
 
 
1050 aa  801  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.24086e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1268  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.35 
 
 
1043 aa  795  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0668  RND efflux transporter  40.27 
 
 
1039 aa  776  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1591  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  74.59 
 
 
1040 aa  1607  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.17 
 
 
1054 aa  796  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4054  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.96 
 
 
1057 aa  791  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.422503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2877  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.37 
 
 
1061 aa  776  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.09 
 
 
1049 aa  1127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4250  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.83 
 
 
1044 aa  781  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3270  multidrug efflux protein  40.69 
 
 
1045 aa  784  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  42.01 
 
 
1034 aa  781  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3716  multidrug resistance protein MdtF  41.5 
 
 
1037 aa  774  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  41.74 
 
 
1049 aa  788  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.26 
 
 
1085 aa  793  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3931  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.91 
 
 
1057 aa  765  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.81 
 
 
1061 aa  777  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.21 
 
 
1066 aa  784  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0164  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.27 
 
 
1064 aa  761  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.780381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.83 
 
 
1044 aa  782  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.37 
 
 
1044 aa  797  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.65 
 
 
1043 aa  843  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.41 
 
 
1048 aa  763  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26926  hitchhiker  0.00468273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.64 
 
 
1048 aa  768  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  41.09 
 
 
1055 aa  781  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.53 
 
 
1038 aa  850  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  58.45 
 
 
1041 aa  1254  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4000  multidrug resistance protein MdtF  41.6 
 
 
1037 aa  776  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  41.91 
 
 
1034 aa  779  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.51 
 
 
1037 aa  847  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2744  RND multidrug efflux transporter MexF  41.04 
 
 
1062 aa  763  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.84 
 
 
1065 aa  838  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02323  hypothetical protein  42.61 
 
 
1037 aa  847  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00418  hypothetical protein  41.74 
 
 
1049 aa  788  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2511  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.32 
 
 
1052 aa  766  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.54 
 
 
1050 aa  770  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.49 
 
 
1056 aa  787  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.97 
 
 
1050 aa  801  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.84 
 
 
1091 aa  776  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  44.88 
 
 
1069 aa  891  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  39.72 
 
 
1057 aa  767  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.81 
 
 
1046 aa  762  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  100 
 
 
1040 aa  2096  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1153  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.33 
 
 
1058 aa  768  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0942  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.14 
 
 
1077 aa  783  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0546  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.02 
 
 
1056 aa  770  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4992  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.48 
 
 
1043 aa  770  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729998  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0308  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47 
 
 
1067 aa  927  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03075  hypothetical protein  41.7 
 
 
1034 aa  780  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03315  hypothetical protein  41.5 
 
 
1037 aa  774  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3048  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.43 
 
 
1047 aa  769  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0601242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2294  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.38 
 
 
1102 aa  768  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.62 
 
 
1044 aa  963  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1621  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  46.95 
 
 
1048 aa  907  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557587  normal  0.228387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6591  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.58 
 
 
1072 aa  767  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490488  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  54.99 
 
 
1042 aa  1170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.32541e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>