More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3326 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 571 aa  1100    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 590 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 550 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  40.29 
 
 		 591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 567 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  40.07 
 
 		 573 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  37.95 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 573 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.53 
 
 		 566 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  44.05 
 
 		 391 aa  273  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  37.99 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  37.07 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 595 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 566 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  37 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 565 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 579 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 575 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 556 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 592 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 568 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  33.15 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  34.63 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 588 aa  203  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 631 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 535 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  34.13 
 
 		 543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 372 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 		 392 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  35.68 
 
 		 401 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  33.1 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 381 aa  120  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  27.12 
 
 		 635 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  32.9 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  31.14 
 
 		 851 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 393 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.02 
 
 		 373 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  31.25 
 
 		 828 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 373 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 665 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  33.19 
 
 		 484 aa  94  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 960 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.79 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 775 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  27.18 
 
 		 622 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.77 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  28.42 
 
 		 673 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  27.78 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 727 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  25.74 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.51 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 550 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 351 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 351 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  26.58 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  25.82 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  25.82 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0766  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  25.68 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  34.62 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  25.99 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  29.11 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  22.19 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  28.57 
 
 		 683 aa  63.9  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>