More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12860 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 174 aa  357  5e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.43 
 
 		 192 aa  216  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.15 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.33 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.74 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.02 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.35 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.33 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.92 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.48 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  41.72 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  48.32 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  46 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  43.4 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.23 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  43.95 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.71 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.9 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.83 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  49.32 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.03 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  49.66 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.56 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  41.98 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.64 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  39.16 
 
 		 180 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.92 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.11 
 
 		 191 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.65 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  43.38 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  43.38 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.94 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  44.12 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.34 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  44.96 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0314  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.91 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.290454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.49 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  40.62 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  35.67 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.91 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 275 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 284 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>