More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06350 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 173 aa  348  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  48.99 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  44.65 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.96 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.21 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.39 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  35.66 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  34.96 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  33.61 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  36.15 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.83 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  34.86 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  27.74 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  31.48 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  34.26 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.83 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  27.04 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  37.1 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  32.03 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.87 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  26.74 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  36.63 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.45 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  33.75 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.26 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>