More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3220 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  67.97 
 
 		 239 aa  287  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  67.41 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  56.83 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  62.78 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  62.44 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  61.5 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  61.86 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  59.03 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  61.93 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46.82 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.6 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.6 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  48.02 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.29 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.24 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  58.29 
 
 		 243 aa  214  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  50.23 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  50.23 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.7 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  47.32 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  47.56 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47.77 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  46.4 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  47.53 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  47.3 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  48.4 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  48.4 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  45.66 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.34 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  46.43 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 319 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  45.37 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  47.35 
 
 		 388 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  48.2 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  46.43 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  48.2 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  46.49 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  45.21 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  54.59 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  46.46 
 
 		 388 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.25 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  46.29 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.14 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.14 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  45.85 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 249 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>