More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5221 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 1357 aa  2707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  61.25 
 
 		 1548 aa  1414    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.43 
 
 		 1343 aa  1143    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.83 
 
 		 1212 aa  1340    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32 
 
 		 905 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  58.54 
 
 		 1176 aa  355  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  30.9 
 
 		 733 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  29.23 
 
 		 717 aa  332  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  29.71 
 
 		 747 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.37 
 
 		 712 aa  311  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.81 
 
 		 904 aa  280  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 805 aa  278  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  26.56 
 
 		 778 aa  270  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  26.47 
 
 		 778 aa  270  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.64 
 
 		 734 aa  267  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.74 
 
 		 792 aa  262  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.64 
 
 		 774 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  30.37 
 
 		 763 aa  249  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.63 
 
 		 762 aa  249  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.43 
 
 		 754 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  29.26 
 
 		 803 aa  246  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 		 768 aa  246  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 763 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  26.93 
 
 		 1037 aa  245  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  25.54 
 
 		 772 aa  244  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  26 
 
 		 777 aa  244  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  25.84 
 
 		 745 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.03 
 
 		 756 aa  242  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  31.89 
 
 		 893 aa  241  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  28.28 
 
 		 808 aa  240  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.91 
 
 		 769 aa  239  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  32.57 
 
 		 875 aa  239  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  27.92 
 
 		 763 aa  238  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  27.8 
 
 		 763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.37 
 
 		 749 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.42 
 
 		 758 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  33.68 
 
 		 902 aa  236  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.7 
 
 		 799 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.55 
 
 		 742 aa  234  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  80.15 
 
 		 723 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  27.55 
 
 		 763 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  27.42 
 
 		 763 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.95 
 
 		 769 aa  233  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  32.16 
 
 		 881 aa  232  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.79 
 
 		 755 aa  232  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.67 
 
 		 758 aa  231  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.2 
 
 		 807 aa  231  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  27.65 
 
 		 762 aa  229  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  27.98 
 
 		 750 aa  229  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  26.24 
 
 		 790 aa  229  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.59 
 
 		 780 aa  228  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  29.43 
 
 		 737 aa  228  6e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.69 
 
 		 757 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  28.13 
 
 		 738 aa  227  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  27.94 
 
 		 743 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  26.7 
 
 		 802 aa  224  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 772 aa  224  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  29.13 
 
 		 721 aa  224  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 755 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.4 
 
 		 889 aa  222  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  27.45 
 
 		 829 aa  222  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 753 aa  222  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25 
 
 		 771 aa  221  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 755 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  27.01 
 
 		 727 aa  220  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 765 aa  220  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 755 aa  220  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  27.01 
 
 		 727 aa  220  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  28.07 
 
 		 764 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 755 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  27.69 
 
 		 764 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.87 
 
 		 795 aa  218  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.48 
 
 		 783 aa  218  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  27.45 
 
 		 735 aa  217  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  27.57 
 
 		 760 aa  217  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.21 
 
 		 755 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.64 
 
 		 760 aa  214  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.19 
 
 		 933 aa  214  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.2 
 
 		 757 aa  214  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.23 
 
 		 790 aa  214  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 882 aa  214  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 882 aa  214  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  26.63 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.5 
 
 		 782 aa  214  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  26.44 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.22 
 
 		 711 aa  213  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.75 
 
 		 751 aa  213  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.26 
 
 		 750 aa  211  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  31.1 
 
 		 972 aa  210  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.09 
 
 		 766 aa  211  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.53 
 
 		 1158 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  26.6 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.69 
 
 		 751 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  25.64 
 
 		 800 aa  210  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.28 
 
 		 768 aa  209  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.22 
 
 		 801 aa  209  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  28.14 
 
 		 733 aa  209  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.81 
 
 		 804 aa  208  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.57 
 
 		 765 aa  208  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>