More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0353 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 511 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.56 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.72 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.81 
 
 		 522 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.42 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 		 522 aa  309  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  43.03 
 
 		 519 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.74 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.05 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.9 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 512 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 512 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 512 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 512 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.69 
 
 		 541 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 		 502 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.03 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.13 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 551 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 500 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 524 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 		 504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.46 
 
 		 532 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 		 551 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.25 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.56 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.26 
 
 		 528 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.19 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  32.79 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.77 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 		 540 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 763 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.86 
 
 		 497 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.15 
 
 		 527 aa  230  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 		 489 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.66 
 
 		 508 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  33.74 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 		 534 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 		 579 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 532 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  36.59 
 
 		 582 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.51 
 
 		 458 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 553 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  38.35 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.61 
 
 		 478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.42 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.61 
 
 		 484 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 510 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.96 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.62 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 512 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.37 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  36.25 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.2 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.2 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 505 aa  220  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 529 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 488 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 583 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
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NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.85 
 
 		 788 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
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NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.96 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.99 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.63 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 		 627 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
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NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
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NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
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NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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