More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0258 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 451 aa  876    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 416 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  34.85 
 
 		 406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  33.08 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 421 aa  143  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 415 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  30.73 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  30.36 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  29.81 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  29.81 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  29.53 
 
 		 408 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  29.53 
 
 		 408 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  29.53 
 
 		 408 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 408 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 		 414 aa  123  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.58 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 405 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.25 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.12 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  36.69 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.54 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 431 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 430 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.06 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  27.37 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  27.37 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  27.37 
 
 		 418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  27.37 
 
 		 418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.47 
 
 		 406 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.92 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.94 
 
 		 688 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.76 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  27.37 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  27.1 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  29.67 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  21.39 
 
 		 362 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 499 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.23 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.76 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.11 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.11 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  29.27 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.22 
 
 		 1833 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>