More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0009 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  59.28 
 
 		 217 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  55.41 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  50.68 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  53.49 
 
 		 220 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  50.91 
 
 		 220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  50.68 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  50.68 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  50 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  50 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  50.44 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  49.55 
 
 		 220 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  51.35 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  48.64 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  45.93 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  45.28 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  44.6 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  41.18 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  41.31 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  40.85 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  40.09 
 
 		 245 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.44 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  37.13 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  35.71 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.25 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  38.16 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  37.56 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.35 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  34.88 
 
 		 297 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  38.65 
 
 		 299 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  34.42 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.48 
 
 		 299 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.33 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.87 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.92 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  34.33 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.68 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  36.41 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.92 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  33.95 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  35.71 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  35.71 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  35.92 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  38 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  34.15 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  34.52 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.15 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  38 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  34.38 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  34.52 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  33.33 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.78 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.55 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  33.94 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  32.14 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  34.95 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.83 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  35.18 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.38 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  38.17 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.38 
 
 		 297 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.38 
 
 		 297 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.38 
 
 		 297 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  34.84 
 
 		 305 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  34.84 
 
 		 305 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  34.84 
 
 		 305 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  35.53 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  34.62 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  34.47 
 
 		 283 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  34.54 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  34.5 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  31.94 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  34.95 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.29 
 
 		 305 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  32.32 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.98 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  35.85 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  34.15 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  33.19 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  34.5 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.96 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  33.98 
 
 		 284 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  35.07 
 
 		 304 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.06 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  32.88 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  35.45 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  34.23 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  34.23 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  34.11 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  34.23 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  34.23 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.49 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.49 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.97 
 
 		 301 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.27 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.84 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  36.97 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  33.33 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>