More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0300 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
436 aa  877    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  78.44 
 
 
436 aa  716    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  98.17 
 
 
436 aa  864    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  97.48 
 
 
436 aa  860    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  58.92 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  53.5 
 
 
429 aa  455  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  51.74 
 
 
432 aa  410  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  46.89 
 
 
429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  47.41 
 
 
429 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  46.63 
 
 
429 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  46.63 
 
 
429 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  46.63 
 
 
438 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  46.37 
 
 
438 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  45.85 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  47.4 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  46.89 
 
 
459 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  46.63 
 
 
466 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  46.63 
 
 
462 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  47.79 
 
 
436 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  45.43 
 
 
435 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  46.55 
 
 
432 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  45.97 
 
 
441 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  45.76 
 
 
429 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 
445 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  46.11 
 
 
433 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  45.01 
 
 
436 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  45.05 
 
 
435 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  45.24 
 
 
445 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 
445 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  42.07 
 
 
476 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  42.07 
 
 
476 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
445 aa  342  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  45.69 
 
 
436 aa  342  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
447 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
437 aa  339  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  42.14 
 
 
487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  46.91 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  48.32 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  47.27 
 
 
435 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 
437 aa  336  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.19 
 
 
433 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  48.06 
 
 
458 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  47.67 
 
 
466 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  48.06 
 
 
458 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  47.67 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  43.86 
 
 
448 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  46.39 
 
 
436 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  45.17 
 
 
442 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
430 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
430 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
430 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
430 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
430 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  45.17 
 
 
442 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
465 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  40.77 
 
 
415 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  39.84 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  39.22 
 
 
438 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  40.29 
 
 
415 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  41.84 
 
 
407 aa  285  8e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  40.31 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 
441 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  39.39 
 
 
441 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  40.74 
 
 
387 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  38.63 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  38.36 
 
 
441 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  34.36 
 
 
443 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  34.36 
 
 
438 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  38.08 
 
 
441 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  30.45 
 
 
456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  29.74 
 
 
433 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  31.82 
 
 
438 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  28.84 
 
 
433 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  30.79 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.33 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  30.1 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  30.5 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.21 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  30.54 
 
 
444 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.77 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  29.18 
 
 
458 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  29.49 
 
 
461 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  30.59 
 
 
482 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  30.5 
 
 
444 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  30.02 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  30.57 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
444 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0168  major facilitator family transporter  33.68 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  29.32 
 
 
440 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
440 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  30.49 
 
 
422 aa  188  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
452 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
425 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.01 
 
 
430 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  32.14 
 
 
440 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  28.93 
 
 
422 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
435 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  30.49 
 
 
438 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
443 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>