204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1091 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1091  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1121  heat-inducible transcription repressor  59.54 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2044  heat-inducible transcription repressor  59.92 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0514653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0151  heat-inducible transcription repressor  58.02 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000619699  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0848  heat-inducible transcription repressor  46.36 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0937  heat-inducible transcription repressor  45.74 
 
 		 260 aa  235  7e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0773  heat-inducible transcription repressor  45.98 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.149257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1260  heat-inducible transcription repressor  41.38 
 
 		 240 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.775914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1360  heat-inducible transcription repressor  37.74 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000135051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.75 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.03 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.79 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  38.81 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  41.79 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.99 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.19 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.19 
 
 		 344 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.67 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.71 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.19 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.05 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.91 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0673  heat-inducible transcription repressor  39.39 
 
 		 392 aa  53.5  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.538731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.83 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.67 
 
 		 341 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.77 
 
 		 351 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  35.82 
 
 		 372 aa  53.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  27.88 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  39.39 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.18 
 
 		 340 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  27.88 
 
 		 346 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  42.37 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 		 344 aa  52.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.08 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  42.37 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2097  negative regulator of class I heat shock protein  35.94 
 
 		 324 aa  52  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.72 
 
 		 354 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  27.27 
 
 		 352 aa  52  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  36.76 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.31 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.58 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.81 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  25.47 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.25 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  34.25 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.08 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  25.47 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.53 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.94 
 
 		 340 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  34.85 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  34.67 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.08 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.97 
 
 		 344 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.54 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.24 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  26.63 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.67 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.39 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  37.31 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  33.33 
 
 		 352 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.33 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.08 
 
 		 359 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.14 
 
 		 343 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0009  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.14 
 
 		 348 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 343 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 354 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.43 
 
 		 344 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 347 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  40 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 347 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.58 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 347 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.51 
 
 		 337 aa  48.9  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 345 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  40.68 
 
 		 336 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  25 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>