More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10733 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
653 aa  1331    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.73 
 
 
613 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.01 
 
 
641 aa  587  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.95 
 
 
652 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.69 
 
 
643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.05 
 
 
647 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.49 
 
 
638 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.05 
 
 
647 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.67 
 
 
646 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.93 
 
 
651 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.85 
 
 
644 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 
626 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.9 
 
 
614 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.16 
 
 
607 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.49 
 
 
642 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  37.57 
 
 
635 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.62 
 
 
664 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.250562  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  39.53 
 
 
647 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 
615 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.09 
 
 
613 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 
617 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.59 
 
 
609 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.37 
 
 
612 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.69 
 
 
613 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  35 
 
 
665 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.61 
 
 
635 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.21 
 
 
612 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.17 
 
 
627 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.54 
 
 
629 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.71 
 
 
613 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  35.06 
 
 
614 aa  364  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.65 
 
 
614 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.24 
 
 
652 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  34.81 
 
 
656 aa  361  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.68 
 
 
625 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.53 
 
 
628 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.32 
 
 
627 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  35.37 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.9 
 
 
627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.1 
 
 
610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3895  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.12 
 
 
381 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.42 
 
 
627 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.42 
 
 
627 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.42 
 
 
627 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.37 
 
 
616 aa  353  5.9999999999999994e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.14 
 
 
637 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.54 
 
 
478 aa  353  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  39.57 
 
 
603 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.99 
 
 
629 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.6 
 
 
630 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.73 
 
 
623 aa  350  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
664 aa  350  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1040  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.21 
 
 
633 aa  349  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  35.93 
 
 
621 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  36.19 
 
 
625 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  36.11 
 
 
621 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  35.95 
 
 
642 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  39.57 
 
 
604 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.56 
 
 
487 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.17 
 
 
612 aa  346  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.07 
 
 
670 aa  345  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.71 
 
 
656 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.19 
 
 
664 aa  341  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.6 
 
 
650 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.29 
 
 
611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.29 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.51 
 
 
649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1769  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.64 
 
 
577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.64 
 
 
620 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4862  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.9 
 
 
600 aa  334  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428479  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.99 
 
 
655 aa  333  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.27 
 
 
652 aa  333  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  35.67 
 
 
646 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.58 
 
 
615 aa  333  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.1 
 
 
643 aa  331  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.54 
 
 
646 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.29 
 
 
653 aa  331  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.6 
 
 
619 aa  331  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.18 
 
 
688 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.72 
 
 
675 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  33.07 
 
 
635 aa  330  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  33.61 
 
 
649 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.81 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  36.68 
 
 
587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  31.64 
 
 
670 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.49 
 
 
637 aa  326  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.97 
 
 
653 aa  326  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.74 
 
 
635 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.02 
 
 
646 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  33.62 
 
 
635 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.97 
 
 
647 aa  324  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  35.38 
 
 
646 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0605  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.81 
 
 
666 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0935812  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.22 
 
 
648 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>