More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1040 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1040  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 633 aa  1220    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.75 
 
 		 664 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.250562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.03 
 
 		 652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4568  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.54 
 
 		 731 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.730165  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  39.2 
 
 		 621 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.36 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  38.95 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.23 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  39.32 
 
 		 621 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.48 
 
 		 646 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.37 
 
 		 635 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.92 
 
 		 647 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  39.26 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.33 
 
 		 638 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.48 
 
 		 653 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4163  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.55 
 
 		 643 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737802  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.77 
 
 		 626 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  40.72 
 
 		 614 aa  363  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5666  putative polysaccharide biosynthesis protein  43.13 
 
 		 637 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.811762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.32 
 
 		 644 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1604  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.61 
 
 		 651 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1300  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.34 
 
 		 642 aa  362  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.92 
 
 		 614 aa  361  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4506  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 		 641 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.22 
 
 		 647 aa  359  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0931663  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.78 
 
 		 637 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.77 
 
 		 642 aa  356  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.85 
 
 		 613 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 		 617 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  35.96 
 
 		 635 aa  353  7e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.58 
 
 		 643 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.59 
 
 		 651 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.87 
 
 		 643 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.28 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  39.18 
 
 		 649 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4862  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 		 600 aa  347  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428479  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.93 
 
 		 628 aa  347  5e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.54 
 
 		 652 aa  346  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1616  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.45 
 
 		 638 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 		 613 aa  344  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.81 
 
 		 648 aa  344  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.81 
 
 		 623 aa  342  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.54 
 
 		 625 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  33.5 
 
 		 603 aa  342  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2312  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.42 
 
 		 657 aa  342  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623811  normal  0.165216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.27 
 
 		 613 aa  341  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.59 
 
 		 607 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2037  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.42 
 
 		 675 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 		 629 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  39.77 
 
 		 656 aa  339  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  40.21 
 
 		 625 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.18 
 
 		 620 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.1 
 
 		 680 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4459  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.65 
 
 		 641 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.69 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.36 
 
 		 609 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  40.03 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.92 
 
 		 612 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 		 650 aa  336  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  38.27 
 
 		 635 aa  334  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.66 
 
 		 612 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.45 
 
 		 627 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.13 
 
 		 628 aa  332  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2927  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 		 633 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 		 627 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 		 627 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.83 
 
 		 676 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.29 
 
 		 645 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 		 627 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.67 
 
 		 629 aa  330  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.5 
 
 		 612 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.53 
 
 		 635 aa  329  9e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  41.52 
 
 		 642 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.03 
 
 		 627 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.89 
 
 		 641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.16 
 
 		 487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2799  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.82 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.14 
 
 		 611 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.14 
 
 		 607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.82 
 
 		 670 aa  324  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.74 
 
 		 656 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.07 
 
 		 627 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.93 
 
 		 656 aa  323  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.16 
 
 		 614 aa  323  7e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.29 
 
 		 630 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  39.3 
 
 		 635 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.28 
 
 		 633 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.36 
 
 		 616 aa  320  6e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.59 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.56 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.19 
 
 		 646 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.83 
 
 		 664 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.56 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>