More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4459 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4459  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
641 aa  1241    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.33 
 
 
652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.52 
 
 
664 aa  357  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.250562  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4568  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.53 
 
 
731 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.730165  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.7 
 
 
626 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.33 
 
 
644 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1040  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.4 
 
 
633 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  39.81 
 
 
647 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.43 
 
 
646 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.37 
 
 
633 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.22 
 
 
638 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.55 
 
 
647 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  51.08 
 
 
635 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.91 
 
 
613 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  39.68 
 
 
615 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.6 
 
 
614 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.25 
 
 
614 aa  310  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.7 
 
 
680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
617 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.78 
 
 
647 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.16 
 
 
642 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.22 
 
 
645 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.02 
 
 
635 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.69 
 
 
613 aa  303  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.18 
 
 
650 aa  303  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.41 
 
 
487 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.31 
 
 
651 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.16 
 
 
478 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.38 
 
 
647 aa  301  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.4 
 
 
643 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.99 
 
 
607 aa  300  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.29 
 
 
682 aa  300  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.29 
 
 
648 aa  300  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.08 
 
 
612 aa  299  9e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.46 
 
 
612 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.48 
 
 
637 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.5 
 
 
625 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4506  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.31 
 
 
641 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  37.91 
 
 
635 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.45 
 
 
613 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.1 
 
 
635 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4163  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.19 
 
 
643 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737802  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.71 
 
 
653 aa  294  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.86 
 
 
630 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.44 
 
 
616 aa  293  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.22 
 
 
628 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.75 
 
 
652 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2927  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.33 
 
 
633 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.914767  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.07 
 
 
647 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.97 
 
 
641 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  36.11 
 
 
621 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  40.57 
 
 
614 aa  290  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  36.11 
 
 
621 aa  289  8e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  38.1 
 
 
625 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.11 
 
 
630 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.18 
 
 
629 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.75 
 
 
637 aa  287  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.34 
 
 
609 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2312  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.35 
 
 
657 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623811  normal  0.165216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48 
 
 
627 aa  286  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  33.89 
 
 
604 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  32.9 
 
 
603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.22 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.52 
 
 
610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2037  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.35 
 
 
675 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.73 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.96 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.96 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.96 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.34 
 
 
679 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  37.2 
 
 
649 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.62 
 
 
620 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.94 
 
 
605 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  39.11 
 
 
637 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.94 
 
 
605 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.11 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  39.11 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.5 
 
 
612 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.11 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  39.11 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  39.11 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  39.11 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.7 
 
 
627 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  39.27 
 
 
656 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.25 
 
 
627 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.59 
 
 
628 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0949  general glycosylation pathway protein  33.57 
 
 
597 aa  281  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.266256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1300  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.6 
 
 
642 aa  280  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.71 
 
 
615 aa  280  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48 
 
 
655 aa  280  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  33.78 
 
 
587 aa  278  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5666  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.82 
 
 
637 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.811762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.84 
 
 
652 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 
619 aa  277  4e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1263  general glycosylation pathway protein  34.7 
 
 
590 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.33 
 
 
664 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  33.64 
 
 
665 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  44.73 
 
 
665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1138  general glycosylation pathway protein  34.7 
 
 
590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.550891  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0447  FO synthase subunit 2 (7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase subunit 2)  33.39 
 
 
593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>