More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2927 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2927  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
633 aa  1248    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.914767  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.53 
 
 
652 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.11 
 
 
664 aa  337  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.250562  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.81 
 
 
635 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1040  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.97 
 
 
633 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  35.36 
 
 
647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.9 
 
 
646 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.36 
 
 
647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4568  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.12 
 
 
731 aa  320  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.730165  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.48 
 
 
626 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.11 
 
 
647 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.32 
 
 
644 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.67 
 
 
614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.91 
 
 
642 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  35.48 
 
 
635 aa  312  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.06 
 
 
613 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
607 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.53 
 
 
638 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  36.06 
 
 
615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.92 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  35.45 
 
 
621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.13 
 
 
630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  35.27 
 
 
621 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  36.8 
 
 
625 aa  303  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.83 
 
 
682 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  35.47 
 
 
649 aa  298  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  37.02 
 
 
614 aa  297  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.85 
 
 
637 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.67 
 
 
660 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
617 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.57 
 
 
637 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.1 
 
 
628 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.92 
 
 
627 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.67 
 
 
627 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  36.4 
 
 
656 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.68 
 
 
627 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.58 
 
 
612 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.27 
 
 
633 aa  289  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  36.81 
 
 
635 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.9 
 
 
616 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 
625 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.01 
 
 
635 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4459  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 
641 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.59 
 
 
612 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.55 
 
 
651 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  35.85 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.69 
 
 
629 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  35.85 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  35.85 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.85 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.85 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  35.85 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  36.04 
 
 
637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.08 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.08 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.08 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.6 
 
 
630 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0447  FO synthase subunit 2 (7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase subunit 2)  33 
 
 
593 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.16 
 
 
643 aa  283  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  34.3 
 
 
604 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.52 
 
 
612 aa  283  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.65 
 
 
653 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.96 
 
 
670 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.06 
 
 
478 aa  282  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.02 
 
 
613 aa  281  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.65 
 
 
680 aa  280  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.85 
 
 
676 aa  280  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1604  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.85 
 
 
651 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43289  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.3 
 
 
652 aa  279  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  33.88 
 
 
603 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1300  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.22 
 
 
642 aa  279  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
614 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.53 
 
 
613 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  36.03 
 
 
635 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1354  putative epimerase/dehydratase WbiI  34.24 
 
 
595 aa  276  6e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.58 
 
 
656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1202  putative epimerase/dehydratase WbiI  33.97 
 
 
593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.08 
 
 
610 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4506  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.72 
 
 
641 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 
644 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  32.77 
 
 
587 aa  272  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.07 
 
 
641 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.41 
 
 
619 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.59 
 
 
620 aa  271  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.77 
 
 
645 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2037  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.15 
 
 
675 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.97 
 
 
652 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1616  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.89 
 
 
638 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688327  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.2 
 
 
594 aa  267  5e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.61 
 
 
623 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2312  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.15 
 
 
657 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623811  normal  0.165216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4163  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.48 
 
 
643 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737802  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.36 
 
 
628 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
647 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0931663  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5666  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.9 
 
 
637 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.811762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.47 
 
 
487 aa  265  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.42 
 
 
609 aa  265  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.43 
 
 
665 aa  264  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.74 
 
 
664 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.15 
 
 
605 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>