More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07931 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.58 
 
 		 652 aa  917    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  56.87 
 
 		 673 aa  725    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.88 
 
 		 685 aa  698    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  55.89 
 
 		 691 aa  684    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  100 
 
 		 691 aa  1406    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.44 
 
 		 676 aa  708    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.61 
 
 		 641 aa  887    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  54.45 
 
 		 692 aa  690    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 		 697 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.88 
 
 		 696 aa  704    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.16 
 
 		 673 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.34 
 
 		 697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 		 694 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 		 699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  47.52 
 
 		 817 aa  567  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.08 
 
 		 706 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  56.98 
 
 		 699 aa  561  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.47 
 
 		 686 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  48.41 
 
 		 694 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  45.1 
 
 		 787 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  48.09 
 
 		 867 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  49.43 
 
 		 648 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  48.11 
 
 		 883 aa  533  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 		 621 aa  535  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.1 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 		 621 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  46.38 
 
 		 627 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 		 649 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 		 629 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.84 
 
 		 618 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  45.5 
 
 		 632 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.82 
 
 		 631 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  45.18 
 
 		 629 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.66 
 
 		 631 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.66 
 
 		 631 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  53.06 
 
 		 628 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  45.5 
 
 		 628 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.34 
 
 		 627 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.34 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.57 
 
 		 628 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.18 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.34 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.98 
 
 		 629 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  49.71 
 
 		 641 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.71 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.52 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.23 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.88 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  49.42 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.97 
 
 		 630 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.71 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.28 
 
 		 637 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  44.37 
 
 		 626 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.71 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.44 
 
 		 638 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 		 642 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.1 
 
 		 638 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.9 
 
 		 653 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  58.2 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  45.36 
 
 		 658 aa  504  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  44.87 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.95 
 
 		 630 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.36 
 
 		 647 aa  505  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.3 
 
 		 696 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  45.85 
 
 		 639 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 		 643 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.29 
 
 		 655 aa  505  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.7 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.3 
 
 		 714 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 		 602 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 		 646 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  43.88 
 
 		 617 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.76 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.27 
 
 		 652 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.5 
 
 		 614 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 		 610 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 		 627 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.97 
 
 		 608 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.54 
 
 		 669 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.73 
 
 		 697 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.1 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.42 
 
 		 652 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.73 
 
 		 697 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.37 
 
 		 636 aa  496  1e-139  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.7 
 
 		 610 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  46.57 
 
 		 651 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 		 812 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.7 
 
 		 641 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  43.72 
 
 		 617 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.35 
 
 		 663 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.19 
 
 		 621 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  49.61 
 
 		 650 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>