232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01180 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  100 
 
 		 294 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  37.67 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  37.86 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  37.74 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  36.05 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  34.64 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 297 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  37.68 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  31.18 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  35.44 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.88 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.14 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.74 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.13 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  26.61 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.18 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.62 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.25 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.58 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.78 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.41 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.42 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  22.8 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24.44 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.55 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  22.42 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  25 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  22.64 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  22.64 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  24.56 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  22.66 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  24.11 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>