More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1335 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  44.36 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  43.82 
 
 		 302 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 290 aa  195  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  42.05 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.64 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  39.57 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.8 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  35.85 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 294 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  33.56 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  31.16 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  33.8 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  29.83 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.59 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  33.57 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>