215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0762 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 158 aa  76.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.78 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.14 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.69 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  35.56 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.38 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  28.42 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  35.8 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  36.36 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>