More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4279 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  96.12 
 
 		 361 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 361 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  74.66 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  72.1 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  71.55 
 
 		 358 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  71.55 
 
 		 358 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  71.27 
 
 		 358 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  71.27 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  71.27 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  70.99 
 
 		 358 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  69.61 
 
 		 358 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  71.27 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  71.27 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  71.27 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  54.99 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  52.76 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  55.29 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  54.68 
 
 		 356 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  51.93 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  51.93 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  54.05 
 
 		 352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  54.05 
 
 		 352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  54.19 
 
 		 351 aa  339  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  51.91 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  49.05 
 
 		 361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  42.03 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  41.76 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  40.62 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  42.42 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  46.5 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.28 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  37.36 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  37.36 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.14 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  37.46 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  37.87 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  38.81 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  36.11 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  36.11 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  35.41 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  34.22 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  34.48 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.39 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.65 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  34.56 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  33.91 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  34.38 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  33.91 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  34.68 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  34.68 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.37 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  31.84 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.07 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  32.01 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.97 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.29 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  31.79 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.79 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  31.79 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.87 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  32.26 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.76 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.61 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  31.59 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  32.6 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.79 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.25 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.4 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  32.08 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  31.19 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  33.04 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  30.17 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  33.85 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  29.94 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  32.57 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  32.48 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  30.73 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  33.24 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  31.94 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  30 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  31.28 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  31.51 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.29 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  32.26 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  30.99 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  29.16 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  30.83 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.74 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.12 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.74 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.34 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  31.49 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  32.52 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.42 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  29.52 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  29.52 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  29.52 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  32.52 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  32.52 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>