More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2113 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  77.42 
 
 		 528 aa  884    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  61.19 
 
 		 523 aa  658    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1100    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  79.32 
 
 		 526 aa  905    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  60.99 
 
 		 523 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  81.07 
 
 		 526 aa  888    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  52.57 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  53.15 
 
 		 532 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  52.79 
 
 		 538 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 		 544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  45.69 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  46.45 
 
 		 526 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  45.73 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  45.35 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  44.11 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  43.92 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 528 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  46.56 
 
 		 527 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  45.64 
 
 		 527 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  43.38 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  42.08 
 
 		 527 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  41.99 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  38.48 
 
 		 520 aa  364  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.3 
 
 		 528 aa  350  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  36.61 
 
 		 516 aa  329  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 526 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 		 528 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  36.69 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  36.99 
 
 		 520 aa  317  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 525 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  36.56 
 
 		 514 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.69 
 
 		 542 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  36.38 
 
 		 533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  35.82 
 
 		 519 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 520 aa  303  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  36.06 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  35.53 
 
 		 533 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  33.97 
 
 		 518 aa  300  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  35 
 
 		 509 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.73 
 
 		 530 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 514 aa  269  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 		 516 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.83 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 531 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 		 526 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.86 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 532 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 521 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 		 532 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 		 514 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  32.8 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  32.93 
 
 		 522 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  33.27 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 538 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 		 537 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  31.16 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 524 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 549 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.33 
 
 		 535 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 534 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 534 aa  213  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.95 
 
 		 521 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.95 
 
 		 521 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.95 
 
 		 521 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 521 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.89 
 
 		 521 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 532 aa  180  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 527 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 531 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.68 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 589 aa  174  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 495 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.03 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 497 aa  170  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.1 
 
 		 504 aa  170  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.59 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.67 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 		 546 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>