227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2233 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  45.86 
 
 		 883 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  45.79 
 
 		 877 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  77.78 
 
 		 864 aa  1237    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  45.79 
 
 		 877 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  76.27 
 
 		 864 aa  1216    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  95.65 
 
 		 850 aa  1520    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  84.81 
 
 		 864 aa  1410    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 864 aa  1707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  76.27 
 
 		 889 aa  1233    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  75.93 
 
 		 864 aa  1210    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  76.27 
 
 		 889 aa  1233    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  76.27 
 
 		 889 aa  1233    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  75.35 
 
 		 864 aa  1261    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  42.16 
 
 		 875 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  37.6 
 
 		 870 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  43.64 
 
 		 866 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  38.91 
 
 		 869 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  37.04 
 
 		 867 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  37.48 
 
 		 867 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  38.37 
 
 		 880 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  37.96 
 
 		 880 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  38.16 
 
 		 879 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  36.77 
 
 		 871 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  36.89 
 
 		 871 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  38.26 
 
 		 880 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  38.92 
 
 		 880 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  38.31 
 
 		 880 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  38.31 
 
 		 880 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  40.48 
 
 		 881 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  40.84 
 
 		 881 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  35.69 
 
 		 872 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  31.51 
 
 		 881 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  38.88 
 
 		 876 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  35.1 
 
 		 877 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  34.94 
 
 		 863 aa  428  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  34.44 
 
 		 880 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  34.13 
 
 		 863 aa  426  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  34.32 
 
 		 880 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  34.2 
 
 		 872 aa  419  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  38.27 
 
 		 864 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  30.05 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  35.02 
 
 		 854 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  38.14 
 
 		 844 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  35.37 
 
 		 854 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  38.42 
 
 		 844 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  31.61 
 
 		 850 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  31.57 
 
 		 850 aa  383  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  36.33 
 
 		 855 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  30.94 
 
 		 850 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  31.2 
 
 		 850 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  31.23 
 
 		 850 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  33.91 
 
 		 896 aa  351  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  30.99 
 
 		 850 aa  350  9e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  30.99 
 
 		 850 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  35.12 
 
 		 850 aa  345  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  36.56 
 
 		 739 aa  343  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  43.61 
 
 		 429 aa  264  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  34.67 
 
 		 557 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  25.56 
 
 		 861 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.44 
 
 		 861 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  25.44 
 
 		 861 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  25.18 
 
 		 861 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  25.18 
 
 		 861 aa  247  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.18 
 
 		 861 aa  247  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  25.18 
 
 		 861 aa  247  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.85 
 
 		 859 aa  243  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.76 
 
 		 859 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  24.64 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  25.03 
 
 		 851 aa  237  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  27.23 
 
 		 851 aa  234  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  39.87 
 
 		 346 aa  230  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  25.33 
 
 		 858 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  26.77 
 
 		 569 aa  224  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  30.29 
 
 		 556 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  30.47 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  30.47 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  32.09 
 
 		 568 aa  194  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  24.84 
 
 		 851 aa  182  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  30.32 
 
 		 395 aa  177  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  26.09 
 
 		 875 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  32.39 
 
 		 584 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  26.59 
 
 		 862 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  26.62 
 
 		 847 aa  165  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  32.85 
 
 		 840 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.12 
 
 		 844 aa  159  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  32.85 
 
 		 840 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  31.45 
 
 		 840 aa  157  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  32.73 
 
 		 516 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  29.32 
 
 		 861 aa  142  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  25.45 
 
 		 861 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  30.69 
 
 		 590 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  29.52 
 
 		 517 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  23.82 
 
 		 692 aa  126  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  31.91 
 
 		 393 aa  124  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  29.45 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  30.23 
 
 		 339 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  29.19 
 
 		 362 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  30.27 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  30.53 
 
 		 368 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 1118 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>