83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5338 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  82.44 
 
 
1156 aa  1644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  42.25 
 
 
1153 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  81.23 
 
 
1156 aa  1636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  82.27 
 
 
1156 aa  1677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  100 
 
 
1156 aa  2220    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  81.4 
 
 
1156 aa  1668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  81.75 
 
 
1156 aa  1640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  82.44 
 
 
1156 aa  1644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  40.98 
 
 
1155 aa  576  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  32.69 
 
 
1186 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  28.93 
 
 
1163 aa  290  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  28.48 
 
 
1167 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28.43 
 
 
1179 aa  266  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.4 
 
 
1171 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  28.46 
 
 
1153 aa  250  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  26.34 
 
 
1210 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  30.74 
 
 
1152 aa  231  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  60.11 
 
 
188 aa  205  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.94 
 
 
1157 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  31.14 
 
 
1152 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  26.43 
 
 
1153 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  27.95 
 
 
1160 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  31.29 
 
 
1167 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  32.61 
 
 
1155 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  37.45 
 
 
1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  38.97 
 
 
1149 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  31.63 
 
 
1185 aa  130  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  33.82 
 
 
1151 aa  126  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  30 
 
 
1144 aa  121  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
1181 aa  120  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  36.19 
 
 
1181 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  34.72 
 
 
1158 aa  112  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  37.5 
 
 
1201 aa  107  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  32.2 
 
 
1126 aa  96.3  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  32.2 
 
 
1126 aa  95.9  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.76 
 
 
1348 aa  91.3  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  35.32 
 
 
1127 aa  89  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  24.83 
 
 
1065 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  35.52 
 
 
1277 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  23.97 
 
 
812 aa  81.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  24.76 
 
 
1284 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  24.88 
 
 
1280 aa  79  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  35.56 
 
 
883 aa  71.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  29.79 
 
 
974 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.05 
 
 
968 aa  69.7  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  21.55 
 
 
1282 aa  68.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  30.3 
 
 
974 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  30.3 
 
 
974 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  30.3 
 
 
767 aa  68.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  30.3 
 
 
767 aa  68.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  30.3 
 
 
974 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  30.3 
 
 
974 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  26.85 
 
 
979 aa  68.2  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  30.3 
 
 
974 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  23.6 
 
 
1047 aa  67.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  30.3 
 
 
974 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.58 
 
 
729 aa  67.4  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  31.05 
 
 
1467 aa  67  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.94 
 
 
1354 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  31.06 
 
 
973 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  28.79 
 
 
664 aa  62  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  24.83 
 
 
978 aa  61.6  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  24.83 
 
 
978 aa  61.6  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  27.75 
 
 
1414 aa  61.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  28.15 
 
 
922 aa  60.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  26.97 
 
 
787 aa  59.3  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.67 
 
 
922 aa  58.9  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.06 
 
 
1351 aa  58.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  30.43 
 
 
821 aa  57.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.73 
 
 
711 aa  56.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  39.47 
 
 
1194 aa  55.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  29.66 
 
 
768 aa  54.3  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  25.99 
 
 
877 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  26.4 
 
 
830 aa  53.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  27.69 
 
 
890 aa  52.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  38.57 
 
 
94 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  28.64 
 
 
1158 aa  51.6  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  28.85 
 
 
917 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  27.82 
 
 
617 aa  49.7  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  34.57 
 
 
1137 aa  48.1  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  48.15 
 
 
591 aa  46.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  35.29 
 
 
946 aa  45.8  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  38.03 
 
 
723 aa  45.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>