More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0755 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  87.98 
 
 
235 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  88.26 
 
 
235 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  87.83 
 
 
235 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  88.41 
 
 
235 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  88.41 
 
 
235 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  91.06 
 
 
235 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  73.99 
 
 
251 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  73.99 
 
 
251 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  73.99 
 
 
251 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  73.99 
 
 
251 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  73.99 
 
 
251 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  73.54 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.41 
 
 
234 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  57.01 
 
 
228 aa  237  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  55.66 
 
 
228 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.66 
 
 
227 aa  228  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.37 
 
 
227 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
237 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.4 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  51.14 
 
 
239 aa  204  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.07 
 
 
239 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.45 
 
 
243 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.45 
 
 
243 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.72 
 
 
278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
233 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.84 
 
 
237 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0243  cyclic nucleotide-binding  41.47 
 
 
236 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  46.61 
 
 
260 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0313  cyclic nucleotide-binding protein  36.92 
 
 
234 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
230 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  33.18 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3129  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.73 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.23 
 
 
239 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
234 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3781  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
230 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4858  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
230 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.748285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  34.29 
 
 
226 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.38 
 
 
232 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  34 
 
 
226 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.45 
 
 
243 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.15 
 
 
224 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.88 
 
 
243 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.92 
 
 
224 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
224 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0827  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0664388  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.26 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.92 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.63 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  32.39 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  33 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.56 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.99 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.05 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
231 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.3 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 
350 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.33 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
236 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.27 
 
 
225 aa  89  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 
225 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
225 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.8 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  26.44 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.93 
 
 
226 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2515  cyclic nucleotide-binding  28.3 
 
 
231 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>