More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1007 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  61.45 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  53.05 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  52.2 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  55.63 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  54 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  53.33 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  51.88 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  51.61 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  53.25 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  48.57 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.12 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.42 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 177 aa  97.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.12 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  37.97 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  37.64 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 178 aa  87.8  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  36.07 
 
 		 168 aa  87.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.66 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.26 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 172 aa  84.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 357 aa  84  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>