More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7282 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
393 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  61.86 
 
 
402 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  59.06 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  57 
 
 
389 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  57 
 
 
385 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  56.75 
 
 
385 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  59.24 
 
 
391 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  56.89 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  56.89 
 
 
436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  56.28 
 
 
383 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  55.28 
 
 
383 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  56.53 
 
 
383 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  56.89 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  56.89 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  56.5 
 
 
436 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  56.89 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  56.53 
 
 
383 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  56.54 
 
 
395 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  56.89 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  56.64 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  54.98 
 
 
400 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  54.73 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  55.67 
 
 
389 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  55.39 
 
 
389 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  52.18 
 
 
408 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  56.2 
 
 
403 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  50.63 
 
 
389 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  48.29 
 
 
409 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 
409 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  47.94 
 
 
393 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  53.71 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  48.21 
 
 
386 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  48.14 
 
 
388 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  46.46 
 
 
422 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  45.71 
 
 
379 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  46.44 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  44.01 
 
 
408 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.67 
 
 
378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  46.38 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  44.64 
 
 
386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  45.16 
 
 
398 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  44.64 
 
 
380 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  44.58 
 
 
389 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.89 
 
 
381 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  44.09 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  43.81 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  46.29 
 
 
414 aa  282  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.83 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  45.25 
 
 
390 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  44.75 
 
 
390 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  44.75 
 
 
390 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  43.64 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.87 
 
 
396 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.48 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  44.59 
 
 
385 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.29 
 
 
383 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  41.26 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  43.94 
 
 
386 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  43.42 
 
 
385 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  43.6 
 
 
384 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  43.48 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  43.68 
 
 
385 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.87 
 
 
394 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  44.03 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  44.03 
 
 
384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  44.03 
 
 
384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  44.03 
 
 
384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  44.03 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.14 
 
 
399 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  42.57 
 
 
393 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.14 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.14 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.14 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  44.03 
 
 
430 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  44.03 
 
 
430 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.14 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  43.35 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  41.79 
 
 
386 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  44.3 
 
 
384 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  43.35 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  44.3 
 
 
384 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  44.3 
 
 
384 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  41.79 
 
 
386 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  40.63 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  43.85 
 
 
393 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.14 
 
 
394 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  43.83 
 
 
385 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  41.54 
 
 
386 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  43.09 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  42.04 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  43.32 
 
 
384 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.46 
 
 
383 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  42.04 
 
 
386 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>