More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2839 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 314 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 339 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 339 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 319 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  33.92 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  33.45 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.62 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1036  transcriptional regulator of LysR family protein  30.03 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.69 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  29.81 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 342 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  32.5 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.62 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0925  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  27.18 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 320 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  29.3 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.14 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3940  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>