203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2268 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  100 
 
 
597 aa  1160    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  98.99 
 
 
597 aa  1146    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  100 
 
 
597 aa  1160    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  41.75 
 
 
967 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  42.17 
 
 
1417 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  38.01 
 
 
810 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  36.83 
 
 
1613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  48.32 
 
 
655 aa  207  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  45.32 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  37.18 
 
 
1197 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  37.18 
 
 
1197 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  42.47 
 
 
575 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  36.95 
 
 
1197 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  39.95 
 
 
1451 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  40.11 
 
 
1204 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  38.39 
 
 
2832 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  40.32 
 
 
3126 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  58.76 
 
 
589 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  39.55 
 
 
1125 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39.48 
 
 
2868 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  40.88 
 
 
877 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  43.88 
 
 
1390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  34.52 
 
 
3192 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  43.46 
 
 
2504 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  43.89 
 
 
472 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  52.87 
 
 
1190 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  52.87 
 
 
1440 aa  171  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  33.6 
 
 
735 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  44.29 
 
 
1072 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.06 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  35.6 
 
 
990 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  35.48 
 
 
3635 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  35.03 
 
 
4726 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  37.31 
 
 
4191 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.04 
 
 
1246 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  39.09 
 
 
3355 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  33.73 
 
 
4384 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  45.3 
 
 
1117 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  51.12 
 
 
831 aa  137  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
816 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
820 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
816 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
816 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
816 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
831 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  51.12 
 
 
831 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.66 
 
 
1616 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  45.74 
 
 
356 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.98 
 
 
1616 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.98 
 
 
1616 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.43 
 
 
1674 aa  123  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  33.62 
 
 
1309 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.17 
 
 
1588 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  47.03 
 
 
880 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.89 
 
 
1549 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  38.81 
 
 
1713 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  30.71 
 
 
1472 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.98 
 
 
1447 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.98 
 
 
1447 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  44.06 
 
 
1516 aa  120  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.98 
 
 
1342 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  45.95 
 
 
876 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  45.81 
 
 
423 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  35.56 
 
 
3718 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1122 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1074 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1090 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1090 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1090 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1122 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  37.59 
 
 
1122 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  33.82 
 
 
279 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  37.5 
 
 
963 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  41.01 
 
 
1326 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  45.05 
 
 
1012 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  45.05 
 
 
1068 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  44.51 
 
 
962 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  45.05 
 
 
1186 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  43.09 
 
 
192 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  43.09 
 
 
192 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  36.4 
 
 
492 aa  107  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  43.09 
 
 
373 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  43.09 
 
 
373 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  43.09 
 
 
378 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  36.01 
 
 
2392 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  33.33 
 
 
1916 aa  104  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  46.15 
 
 
898 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.69 
 
 
378 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  40.76 
 
 
737 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  36.48 
 
 
1854 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.18 
 
 
460 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.83 
 
 
2095 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  43.45 
 
 
650 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  30.91 
 
 
1814 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  41.76 
 
 
617 aa  90.5  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  36.9 
 
 
533 aa  90.1  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  43.48 
 
 
2396 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  41.48 
 
 
827 aa  89  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  41.89 
 
 
418 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  42.36 
 
 
1654 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>