More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0037 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 377 aa  777    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  60.59 
 
 		 375 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  58.81 
 
 		 376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  59.35 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  58.06 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  60.98 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  60.98 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  56.22 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  54.89 
 
 		 594 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  52.27 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  53.89 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  56.53 
 
 		 615 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  51.48 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  51.48 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  51.87 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  52.17 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  51.89 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  51.9 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  47.47 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  47.47 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 593 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  50.93 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  51.67 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  52.92 
 
 		 579 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  47.33 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.92 
 
 		 604 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.92 
 
 		 579 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  51.47 
 
 		 383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  50.8 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  50.8 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  51.47 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  50.81 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  49.05 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  47.33 
 
 		 369 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  44.96 
 
 		 591 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.4 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.4 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  44.99 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  45.55 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 359 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  43.16 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  44.39 
 
 		 373 aa  289  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  42.63 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.47 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 431 aa  282  5.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.63 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.36 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 376 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 367 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  43.17 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  47.53 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  47.53 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  42.3 
 
 		 350 aa  262  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  42.08 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.33 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  40.49 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  42.47 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>