131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4377 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  100 
 
 		 905 aa  1790    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  41.71 
 
 		 839 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  43.5 
 
 		 850 aa  529  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  37.87 
 
 		 844 aa  419  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  38.32 
 
 		 857 aa  412  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  36.39 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  31.71 
 
 		 852 aa  355  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  43.43 
 
 		 723 aa  321  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  47.43 
 
 		 346 aa  294  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 1118 aa  160  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  31.78 
 
 		 556 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  31.78 
 
 		 556 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  29.09 
 
 		 556 aa  145  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  28.74 
 
 		 568 aa  129  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  28.04 
 
 		 850 aa  114  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 1132 aa  114  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.59 
 
 		 880 aa  107  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  28.71 
 
 		 896 aa  104  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.72 
 
 		 880 aa  104  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  23.8 
 
 		 875 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.34 
 
 		 879 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  25.14 
 
 		 880 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  24.84 
 
 		 569 aa  102  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  25.07 
 
 		 861 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  24.71 
 
 		 578 aa  102  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  27.24 
 
 		 854 aa  102  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  24.84 
 
 		 395 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.41 
 
 		 863 aa  102  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  29.07 
 
 		 880 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  29.07 
 
 		 880 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  24.51 
 
 		 863 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.61 
 
 		 844 aa  99  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  28.37 
 
 		 881 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  28.52 
 
 		 881 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  26.07 
 
 		 855 aa  97.8  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  28.37 
 
 		 880 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  25.77 
 
 		 850 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  21.45 
 
 		 862 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  24.62 
 
 		 867 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  26.87 
 
 		 876 aa  95.9  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  25.29 
 
 		 854 aa  95.9  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.92 
 
 		 859 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.92 
 
 		 859 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  24.67 
 
 		 877 aa  94.7  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  26.3 
 
 		 864 aa  94.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 1113 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.47 
 
 		 847 aa  93.6  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  27.22 
 
 		 877 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  27.22 
 
 		 877 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  21.14 
 
 		 851 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  21.41 
 
 		 851 aa  92.8  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 1172 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  25.94 
 
 		 590 aa  91.7  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 1101 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  24.5 
 
 		 656 aa  89.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.06 
 
 		 861 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  22.06 
 
 		 861 aa  89  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  20.56 
 
 		 917 aa  88.6  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  22.06 
 
 		 861 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  22.06 
 
 		 861 aa  88.6  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  26.18 
 
 		 883 aa  88.2  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  22.06 
 
 		 861 aa  88.2  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  22.06 
 
 		 861 aa  88.2  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.06 
 
 		 861 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  25.36 
 
 		 599 aa  87.8  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 1100 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  26.49 
 
 		 346 aa  87.8  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  25.35 
 
 		 864 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  27.12 
 
 		 844 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  24.23 
 
 		 871 aa  87  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  25.42 
 
 		 875 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  24.23 
 
 		 871 aa  87  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  25.15 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  22.06 
 
 		 861 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  25.35 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  24.44 
 
 		 867 aa  85.5  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  25.35 
 
 		 889 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  25.35 
 
 		 889 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  21.97 
 
 		 813 aa  85.5  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  25.35 
 
 		 889 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  26.64 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  23.82 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.78 
 
 		 858 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  25 
 
 		 864 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  22.78 
 
 		 1098 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 		 1100 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  25 
 
 		 864 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  23.87 
 
 		 869 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  26.33 
 
 		 864 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  22.25 
 
 		 701 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  26.44 
 
 		 844 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  26.64 
 
 		 880 aa  82  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 		 1094 aa  82  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 1111 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  24.49 
 
 		 866 aa  80.5  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  21.47 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  26.3 
 
 		 880 aa  80.1  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 		 1112 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  25.33 
 
 		 872 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  26.07 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>