More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1124 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  41.06 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  39.38 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 233 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 267 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4903  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  36.26 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 269 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  40.67 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>