More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1954 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  85 
 
 
146 aa  250  5e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  70.71 
 
 
157 aa  209  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  44.68 
 
 
350 aa  126  9e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  39.1 
 
 
160 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.86 
 
 
1056 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.04 
 
 
225 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.57 
 
 
1075 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
225 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.08 
 
 
219 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.09 
 
 
225 aa  82.8  2e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.66 
 
 
225 aa  81.3  4e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.85 
 
 
225 aa  81.3  4e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.47 
 
 
224 aa  79  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 
251 aa  79.3  2e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.87 
 
 
226 aa  78.6  3e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.66 
 
 
225 aa  77.8  4e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.39 
 
 
220 aa  76.6  1e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.31 
 
 
225 aa  76.3  1e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
225 aa  75.9  2e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.5 
 
 
155 aa  75.9  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.54 
 
 
224 aa  75.1  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 
226 aa  74.3  5e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30 
 
 
224 aa  74.3  5e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.32 
 
 
228 aa  74.3  6e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.41 
 
 
242 aa  74.3  6e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
224 aa  73.9  7e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27.07 
 
 
417 aa  72.8  1e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 
228 aa  73.2  1e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 
155 aa  73.2  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
225 aa  72.8  1e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.46 
 
 
228 aa  73.2  1e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  30.56 
 
 
222 aa  72.4  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 
563 aa  72.4  2e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
265 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.22196e-09  unclonable  1.02776e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.88 
 
 
231 aa  72.4  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 
237 aa  72.8  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.07 
 
 
226 aa  72  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 
482 aa  72  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.78 
 
 
226 aa  71.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  34.04 
 
 
165 aa  72  3e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.17 
 
 
224 aa  72  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  35.14 
 
 
214 aa  71.2  5e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  70.9  6e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  32.03 
 
 
482 aa  70.9  6e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  70.5  7e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
228 aa  70.5  8e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 
224 aa  70.5  8e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
225 aa  70.1  9e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
169 aa  70.1  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  29.51 
 
 
407 aa  70.1  1e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
419 aa  70.1  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
219 aa  69.7  1e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.51 
 
 
253 aa  69.7  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
224 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
149 aa  68.9  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  33.09 
 
 
161 aa  68.9  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 
220 aa  68.9  2e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.15 
 
 
225 aa  68.9  2e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
224 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
224 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
224 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  30.77 
 
 
265 aa  68.6  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
151 aa  68.2  4e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.52 
 
 
226 aa  68.2  4e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  26.09 
 
 
194 aa  67.8  4e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.75 
 
 
225 aa  68.2  4e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  32.38 
 
 
241 aa  68.2  4e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
226 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
225 aa  67.8  5e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.86 
 
 
243 aa  67.4  6e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
148 aa  67.4  6e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  29.29 
 
 
154 aa  67.4  6e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
225 aa  67.4  6e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  30.94 
 
 
169 aa  67.4  7e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  29.81 
 
 
265 aa  67.4  7e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.60596e-13  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
252 aa  67.4  7e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
229 aa  67  8e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  32.82 
 
 
167 aa  66.6  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
222 aa  66.6  1e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.21 
 
 
224 aa  66.6  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
149 aa  66.2  2e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  33.08 
 
 
167 aa  65.9  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 
171 aa  65.9  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  32.04 
 
 
263 aa  66.2  2e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.84 
 
 
227 aa  65.9  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
228 aa  65.9  2e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.58 
 
 
224 aa  65.5  2e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  31.2 
 
 
583 aa  65.1  3e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
227 aa  65.5  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
577 aa  65.1  3e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 
219 aa  65.1  3e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.27 
 
 
224 aa  65.5  3e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
308 aa  64.7  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.69 
 
 
131 aa  64.7  4e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.86 
 
 
154 aa  64.7  5e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
224 aa  64.3  5e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 
286 aa  64.3  5e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.45 
 
 
454 aa  64.3  6e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.44 
 
 
215 aa  63.9  7e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>