More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4119 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03283  glycogen debranching enzyme  60.79 
 
 		 657 aa  830    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000400543  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0283  glycogen debranching enzyme GlgX  60.79 
 
 		 657 aa  829    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3910  glycogen debranching enzyme  60.79 
 
 		 657 aa  829    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3713  glycogen debranching enzyme  60.79 
 
 		 657 aa  828    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.723997  normal  0.535779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0278  glycogen debranching enzyme  59.15 
 
 		 655 aa  794    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4135  glycogen debranching enzyme  65.81 
 
 		 658 aa  880    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3907  glycogen debranching enzyme  60.64 
 
 		 658 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.385353  normal  0.48763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0281  glycogen debranching enzyme  60.64 
 
 		 657 aa  827    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00281975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4005  glycogen debranching enzyme  99.4 
 
 		 662 aa  1364    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4743  glycogen debranching enzyme  60.64 
 
 		 657 aa  828    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3727  glycogen debranching enzyme  60.49 
 
 		 658 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3804  glycogen debranching enzyme  60.79 
 
 		 658 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3893  glycogen debranching enzyme  60.79 
 
 		 657 aa  828    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  67.17 
 
 		 661 aa  917    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0148  glycogen debranching enzyme  99.55 
 
 		 662 aa  1365    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03236  hypothetical protein  60.79 
 
 		 657 aa  830    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00116729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0224  glycogen debranching enzyme  61.12 
 
 		 656 aa  819    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3936  glycogen debranching enzyme  65.66 
 
 		 658 aa  879    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4119  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 662 aa  1370    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.548863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3631  glycogen debranching enzyme  60.64 
 
 		 657 aa  827    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3839  glycogen debranching enzyme  61.85 
 
 		 657 aa  829    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.90909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3846  glycogen debranching enzyme  60.64 
 
 		 658 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.825937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3738  glycogen debranching enzyme  60.49 
 
 		 658 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  48.91 
 
 		 695 aa  625  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  48.78 
 
 		 710 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  48.02 
 
 		 706 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  47.63 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  47.95 
 
 		 701 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  47.69 
 
 		 692 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  47.54 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 721 aa  591  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  47.18 
 
 		 692 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  47.15 
 
 		 691 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  46.84 
 
 		 693 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  49.27 
 
 		 701 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.35 
 
 		 708 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  48.72 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  48.31 
 
 		 688 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  46.12 
 
 		 721 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  47.79 
 
 		 704 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 		 720 aa  579  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  45.99 
 
 		 720 aa  580  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  47.39 
 
 		 701 aa  581  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  45.52 
 
 		 715 aa  578  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0888  glycogen operon protein  47.74 
 
 		 660 aa  578  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  47.65 
 
 		 716 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 723 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  48.52 
 
 		 1537 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  48.76 
 
 		 754 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0414  glycogen debranching enzyme GlgX  50.23 
 
 		 693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  47.45 
 
 		 714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  47.58 
 
 		 729 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  47.5 
 
 		 716 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  48.69 
 
 		 708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  47.11 
 
 		 755 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  44.51 
 
 		 751 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  46.66 
 
 		 757 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  49.76 
 
 		 743 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  49.19 
 
 		 739 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  45.17 
 
 		 718 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  49.51 
 
 		 739 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.15 
 
 		 755 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  47.18 
 
 		 704 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  48.16 
 
 		 702 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  48.63 
 
 		 722 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 714 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  45.84 
 
 		 712 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  45.54 
 
 		 710 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 707 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  47.58 
 
 		 702 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  45.88 
 
 		 733 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  48.87 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  46.04 
 
 		 722 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  45.05 
 
 		 714 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  47.05 
 
 		 704 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  47.15 
 
 		 758 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  47.26 
 
 		 766 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  47.15 
 
 		 758 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 714 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  46.23 
 
 		 709 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  47.26 
 
 		 766 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  46.95 
 
 		 720 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  45.98 
 
 		 727 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  47.01 
 
 		 733 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  46.99 
 
 		 694 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 720 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  45.93 
 
 		 738 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  46.65 
 
 		 708 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  46.68 
 
 		 688 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  47.6 
 
 		 719 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  45.86 
 
 		 738 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  46.2 
 
 		 730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  46.19 
 
 		 713 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  48.14 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  46.99 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  47.6 
 
 		 779 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  44.82 
 
 		 723 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  49.17 
 
 		 691 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  47.52 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  47.18 
 
 		 702 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>