More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3947 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
483 aa  943    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0219  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
488 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
490 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2601  sensor histidine kinase  30.39 
 
 
484 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.86607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0383  histidine kinase  28.03 
 
 
482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3087  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
481 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.459224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  33.77 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
364 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
987 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  23.28 
 
 
581 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
832 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  31.02 
 
 
981 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
631 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1131 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
543 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  24.4 
 
 
500 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
1519 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  23.51 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.84 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
991 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
699 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
991 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1855  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.61 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  27.82 
 
 
983 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
991 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
510 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  29.75 
 
 
830 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2473  sensor histidine kinase  27.5 
 
 
493 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
581 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
576 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
981 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  27.42 
 
 
983 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
495 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  25.56 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  25.35 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  29.11 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
705 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1624  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
496 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
680 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  29.87 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
829 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  28.34 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  28.83 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 
544 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  26.64 
 
 
984 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 
801 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
991 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.79 
 
 
744 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  26.32 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  31.3 
 
 
506 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  27.05 
 
 
982 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  24.48 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  28.51 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  27.06 
 
 
923 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32.55 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  27.16 
 
 
986 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
671 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
713 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
620 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 
709 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
518 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  22.31 
 
 
801 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
674 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
707 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
498 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2392  histidine kinase  30.09 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
653 aa  68.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
611 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
893 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 
711 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
655 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>